输血科是医院独立设置的临床供血服务机构。1956年建院伊始，输血科以“血库组”名义隶属于当时的麻醉科。1993年正式更名为输血科。现有教职员工18人，其中正高职称2人，副高职称1人，中级职称8人，初级职称7人；具有博士学位研究生1人，硕士学位研究生9人；医师4人，技师14人。中国医师协会输血科医师分会常委单位、新疆维吾尔自治区临床输血质量控制中心副主委单位。科室总面积600余平方米，设有红细胞实验室和组织配型实验室两个功能室。科室时刻以“输血安全”为工作目标，建立了一套完整科学的临床用血质量管理体系。经过20多年发展，不断学习、引进国内外先进的输血知识和技术，现已由单纯的采供血血库建设发展成为集医疗、教学、科研为一体，疆内领先的综合性医技科室。输血科主要任务是：承担医疗、教学和科研等各项任务，负责血液制品的入库、保存和检测，向临床提供合格的血型鉴定及交叉配血试验等各项检测报告单，器官移植的相关实验检测工作，参与临床用血管理，推动临床科学合理用血，保护血液资源，保障临床用血安全和医疗质量。

科室目前开展的检查项目有：ABO血型正反定型及Rh(D) 血型鉴定、ABO血型系统亚型鉴定、疑难血型鉴定、交叉配血试验及疑难交叉配血试验、不规则抗体筛选与鉴定、血型抗体效价测定、血型全套检测、新生儿溶血病检测、血小板抗体试验、血栓弹力图试验、产前夫妻血型血清学检测、吸收放散试验、抗人球蛋白试验、输血不良反应监测、肾移植及造血干细胞移植前后的HLA配型检测、群体反应抗体(PRA) 检测、交叉淋巴细胞毒实验(CDC) 等。供应临床的血液成分有：全血、悬浮红细胞、洗涤红细胞、单采血小板、手工分离

浓缩血小板、新鲜冰冻血浆、去病毒冰冻血浆、冷沉淀凝血因子和Rh阴性血液等，保证了临床及手术期间的及时供血、安全输血。